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chr7	4783403	TTAAGACCAGATATCAAAAGAGG	cTgAGACCAaATATCAAAcGAGG	4	Gossypiumhirsutum_771	gene	ID=gene-LOC107933156;Dbxref=GeneID:107933156;Name=LOC107933156;description=transcription
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chr7	2610838	AGGATTCACTTCGCCAGACAGGG	gGGATTtgCTTCGCCAGAtAGGG	4	Gossypiumhirsutum_841	exon	ID=exon-XM_041117157.1-6;Parent=rna-XM_041117157.1;Dbxref=GeneID:107929934,GenBank:XM_041117157.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107929934;product=uncharacterized
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chr7	2610838	AGGATTCACTTCGCCAGACAGGG	gGGATTtgCTTCGCCAGAtAGGG	4	Gossypiumhirsutum_841	exon	ID=exon-XM_016861480.2-5;Parent=rna-XM_016861480.2;Dbxref=GeneID:107929934,GenBank:XM_016861480.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107929934;product=uncharacterized
chr7	2610838	AGGATTCACTTCGCCAGACAGGG	gGGATTtgCTTCGCCAGAtAGGG	4	Gossypiumhirsutum_841	CDS	ID=cds-XP_016716969.1;Parent=rna-XM_016861480.2;Dbxref=GeneID:107929934,GenBank:XP_016716969.1;Name=XP_016716969.1;gbkey=CDS;gene=LOC107929934;product=uncharacterized
chr7	12521772	CGGCAGGGCGAGTTGATGTTCGG	CGaCAGGGCcAtgTGATGTTCGG	4	Gossypiumhirsutum_842	gene	ID=gene-LOC121219406;Dbxref=GeneID:121219406;Name=LOC121219406;description=wound-induced
chr7	12521772	CGGCAGGGCGAGTTGATGTTCGG	CGaCAGGGCcAtgTGATGTTCGG	4	Gossypiumhirsutum_842	mRNA	ID=rna-XM_041097512.1;Parent=gene-LOC121219406;Dbxref=GeneID:121219406,GenBank:XM_041097512.1;Name=XM_041097512.1;gbkey=mRNA;gene=LOC121219406;model_evidence=Supporting
chr7	6963361	CAGGGCGAGTTGATGTTCGGAGG	CAGGGCGAGTTGATGTTCctAGG	2	Gossypiumhirsutum_843	gene	ID=gene-LOC121232053;Dbxref=GeneID:121232053;Name=LOC121232053;description=cyclin-dependent
chr7	6963361	CAGGGCGAGTTGATGTTCGGAGG	CAGGGCGAGTTGATGTTCctAGG	2	Gossypiumhirsutum_843	transcript	ID=rna-XR_005930273.1;Parent=gene-LOC121232053;Dbxref=GeneID:121232053,GenBank:XR_005930273.1;Name=XR_005930273.1;gbkey=misc_RNA;gene=LOC121232053;model_evidence=Supporting
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chr7	6963361	CAGGGCGAGTTGATGTTCGGAGG	CAGGGCGAGTTGATGTTCctAGG	2	Gossypiumhirsutum_843	exon	ID=exon-XR_005930272.1-1;Parent=rna-XR_005930272.1;Dbxref=GeneID:121232053,GenBank:XR_005930272.1;gbkey=misc_RNA;gene=LOC121232053;product=cyclin-dependent
chr7	6963361	CAGGGCGAGTTGATGTTCGGAGG	CAGGGCGAGTTGATGTTCctAGG	2	Gossypiumhirsutum_843	mRNA	ID=rna-XM_041117423.1;Parent=gene-LOC121232053;Dbxref=GeneID:121232053,GenBank:XM_041117423.1;Name=XM_041117423.1;gbkey=mRNA;gene=LOC121232053;model_evidence=Supporting
chr7	6963361	CAGGGCGAGTTGATGTTCGGAGG	CAGGGCGAGTTGATGTTCctAGG	2	Gossypiumhirsutum_843	exon	ID=exon-XM_041117423.1-1;Parent=rna-XM_041117423.1;Dbxref=GeneID:121232053,GenBank:XM_041117423.1;gbkey=mRNA;gene=LOC121232053;product=cyclin-dependent
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chr7	94255595	CAGGGCGAGTTGATGTTCGGAGG	CAGtGCGAGTTcATGTTCacAGG	4	Gossypiumhirsutum_844	.	.
chr7	6469348	CAGGGCGAGTTGATGTTCGGAGG	CAGGGCGAGTTGATGTTCctAGG	2	Gossypiumhirsutum_845	gene	ID=gene-LOC121219326;Dbxref=GeneID:121219326;Name=LOC121219326;description=cyclin-dependent
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chr7	6469348	CAGGGCGAGTTGATGTTCGGAGG	CAGGGCGAGTTGATGTTCctAGG	2	Gossypiumhirsutum_845	exon	ID=exon-XR_005915989.1-1;Parent=rna-XR_005915989.1;Dbxref=GeneID:121219326,GenBank:XR_005915989.1;gbkey=misc_RNA;gene=LOC121219326;product=cyclin-dependent
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chr7	6469348	CAGGGCGAGTTGATGTTCGGAGG	CAGGGCGAGTTGATGTTCctAGG	2	Gossypiumhirsutum_845	exon	ID=exon-XR_005915988.1-1;Parent=rna-XR_005915988.1;Dbxref=GeneID:121219326,GenBank:XR_005915988.1;gbkey=misc_RNA;gene=LOC121219326;product=cyclin-dependent
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chr7	6469348	CAGGGCGAGTTGATGTTCGGAGG	CAGGGCGAGTTGATGTTCctAGG	2	Gossypiumhirsutum_845	transcript	ID=rna-XR_005915984.1;Parent=gene-LOC121219326;Dbxref=GeneID:121219326,GenBank:XR_005915984.1;Name=XR_005915984.1;gbkey=misc_RNA;gene=LOC121219326;model_evidence=Supporting
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chr7	6469348	CAGGGCGAGTTGATGTTCGGAGG	CAGGGCGAGTTGATGTTCctAGG	2	Gossypiumhirsutum_845	mRNA	ID=rna-XM_041097269.1;Parent=gene-LOC121219326;Dbxref=GeneID:121219326,GenBank:XM_041097269.1;Name=XM_041097269.1;gbkey=mRNA;gene=LOC121219326;model_evidence=Supporting
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chr7	16008933	GGCCAAACATAGGGATCCACAAG	GGCCAAACATAGGGATCCACAgG	1	Gossypiumhirsutum_953	exon	ID=exon-XM_016892230.2-4;Parent=rna-XM_016892230.2;Dbxref=GeneID:107956642,GenBank:XM_016892230.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107956642;product=CEN-like
chr7	16008933	GGCCAAACATAGGGATCCACAAG	GGCCAAACATAGGGATCCACAgG	1	Gossypiumhirsutum_953	CDS	ID=cds-XP_016747719.1;Parent=rna-XM_016892230.2;Dbxref=GeneID:107956642,GenBank:XP_016747719.1;Name=XP_016747719.1;gbkey=CDS;gene=LOC107956642;product=CEN-like
chr7	28259351	AATGGAGTTTACTGCCCGTTTGG	AATGGAtTTTAaTGgCCGTTaGG	4	Gossypiumhirsutum_954	.	.
chr7	52163069	AATGGAGTTTACTGCCCGTTTGG	AATtGAGTTTAtTGCCCaTTTGG	3	Gossypiumhirsutum_955	.	.
chr7	16600084	TCTCCATGTAGCGACAAGGNNN	TCTCCATGTAtCGgCAAtaGAGG	4	Gossypiumhirsutum_956	.	.
chr7	55217514	TCTCCATGTAGCGACAAGGNNN	TaTaCATGgAGaGACAAGGAAGG	4	Gossypiumhirsutum_957	.	.
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chr6	60870424	ACATGTTTAGCAGATACGGGAGG	ACATGTTTAGCAGATAtGGaAGG	2	Gossypiumhirsutum_1212	exon	ID=exon-XM_016815857.2-2;Parent=rna-XM_016815857.2;Dbxref=GeneID:107891162,GenBank:XM_016815857.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107891162;product=serine/arginine-rich
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chr6	60871660	TTGAATGGTCGAGACTTAGATGG	TTGAATGGTCGAGACcTAGAcGG	2	Gossypiumhirsutum_1215	exon	ID=exon-XM_016815856.2-4;Parent=rna-XM_016815856.2;Dbxref=GeneID:107891162,GenBank:XM_016815856.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107891162;product=serine/arginine-rich
chr6	60871660	TTGAATGGTCGAGACTTAGATGG	TTGAATGGTCGAGACcTAGAcGG	2	Gossypiumhirsutum_1215	CDS	ID=cds-XP_016671345.1;Parent=rna-XM_016815856.2;Dbxref=GeneID:107891162,GenBank:XP_016671345.1;Name=XP_016671345.1;gbkey=CDS;gene=LOC107891162;product=serine/arginine-rich
chr6	60871660	TTGAATGGTCGAGACTTAGATGG	TTGAATGGTCGAGACcTAGAcGG	2	Gossypiumhirsutum_1215	mRNA	ID=rna-XM_016815857.2;Parent=gene-LOC107891162;Dbxref=GeneID:107891162,GenBank:XM_016815857.2;Name=XM_016815857.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107891162;model_evidence=Supporting
chr6	60871660	TTGAATGGTCGAGACTTAGATGG	TTGAATGGTCGAGACcTAGAcGG	2	Gossypiumhirsutum_1215	exon	ID=exon-XM_016815857.2-4;Parent=rna-XM_016815857.2;Dbxref=GeneID:107891162,GenBank:XM_016815857.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107891162;product=serine/arginine-rich
chr6	60871660	TTGAATGGTCGAGACTTAGATGG	TTGAATGGTCGAGACcTAGAcGG	2	Gossypiumhirsutum_1215	CDS	ID=cds-XP_016671346.1;Parent=rna-XM_016815857.2;Dbxref=GeneID:107891162,GenBank:XP_016671346.1;Name=XP_016671346.1;gbkey=CDS;gene=LOC107891162;product=serine/arginine-rich
chr6	22550955	TTGAATGGTCGAGACTTAGATGG	TTGAATGtTCGtGACcgAGATGG	4	Gossypiumhirsutum_1216	.	.
chr6	72250585	ACATGTTTAGCAGATATGGGAGG	AgATtTaTAGCAGATATGGGAaG	4	Gossypiumhirsutum_1217	.	.
chr6	122027760	ACATGTTTAGCAGATATGGGAGG	ACATGTTTAGCAGATATGGaAGG	1	Gossypiumhirsutum_1218	exon	ID=exon-XM_016875124.2-2;Parent=rna-XM_016875124.2;Dbxref=GeneID:107941565,GenBank:XM_016875124.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107941565;product=serine/arginine-rich
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chr6	60870424	ACATGTTTAGCAGATATGGGAGG	ACATGTTTAGCAGATATGGaAGG	1	Gossypiumhirsutum_1221	exon	ID=exon-XM_016815854.2-2;Parent=rna-XM_016815854.2;Dbxref=GeneID:107891162,GenBank:XM_016815854.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107891162;product=serine/arginine-rich
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chr6	60870424	ACATGTTTAGCAGATATGGGAGG	ACATGTTTAGCAGATATGGaAGG	1	Gossypiumhirsutum_1221	exon	ID=exon-XM_016815856.2-2;Parent=rna-XM_016815856.2;Dbxref=GeneID:107891162,GenBank:XM_016815856.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107891162;product=serine/arginine-rich
chr6	60870424	ACATGTTTAGCAGATATGGGAGG	ACATGTTTAGCAGATATGGaAGG	1	Gossypiumhirsutum_1221	CDS	ID=cds-XP_016671345.1;Parent=rna-XM_016815856.2;Dbxref=GeneID:107891162,GenBank:XP_016671345.1;Name=XP_016671345.1;gbkey=CDS;gene=LOC107891162;product=serine/arginine-rich
chr6	60870424	ACATGTTTAGCAGATATGGGAGG	ACATGTTTAGCAGATATGGaAGG	1	Gossypiumhirsutum_1221	mRNA	ID=rna-XM_016815857.2;Parent=gene-LOC107891162;Dbxref=GeneID:107891162,GenBank:XM_016815857.2;Name=XM_016815857.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107891162;model_evidence=Supporting
chr6	60870424	ACATGTTTAGCAGATATGGGAGG	ACATGTTTAGCAGATATGGaAGG	1	Gossypiumhirsutum_1221	exon	ID=exon-XM_016815857.2-2;Parent=rna-XM_016815857.2;Dbxref=GeneID:107891162,GenBank:XM_016815857.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107891162;product=serine/arginine-rich
chr6	60870424	ACATGTTTAGCAGATATGGGAGG	ACATGTTTAGCAGATATGGaAGG	1	Gossypiumhirsutum_1221	CDS	ID=cds-XP_016671346.1;Parent=rna-XM_016815857.2;Dbxref=GeneID:107891162,GenBank:XP_016671346.1;Name=XP_016671346.1;gbkey=CDS;gene=LOC107891162;product=serine/arginine-rich
chr6	127826696	AAAGGCGTGTACCACTACCGCGG	AAtcGCtTGTACCACTACCtCGG	4	Gossypiumhirsutum_1222	.	.
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chr5	63211708	TGTGCGTGAATCCATGGTTGTGG	TGTtttTGAATCCATGGTTGgGG	4	Gossypiumhirsutum_1646	exon	ID=exon-XR_005927887.1-1;Parent=rna-XR_005927887.1;Dbxref=GeneID:121229936,RFAM:RF00097,GenBank:XR_005927887.1;gbkey=ncRNA;gene=LOC121229936;inference=COORDINATES:
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chr5	50938596	TCAAGGACTGGATCTTTCGGAGG	TCAAGGAtTGaATCTTaCGGAGG	3	Gossypiumhirsutum_1789	.	.
chr5	108306545	GTAGCAATGCCCTATACTGGTGG	caAGCAATGCCCTATtCTtGTGG	4	Gossypiumhirsutum_1790	.	.
chr5	10919231	GTAGCAATGCCCTATACTGGTGG	GTgGCcATGCCCTATACTGGTGG	2	Gossypiumhirsutum_1791	exon	ID=exon-XR_005927055.1-2;Parent=rna-XR_005927055.1;Dbxref=GeneID:107944360,GenBank:XR_005927055.1;gbkey=misc_RNA;gene=LOC107944360;product=uncharacterized
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chr5	55467626	AATGGAGTTTACTGCCCGTTTGG	AATGGgGTTTAaaGCCCaTTTGG	4	Gossypiumhirsutum_1880	gene	ID=gene-LOC107904036;Dbxref=GeneID:107904036;Name=LOC107904036;description=probable
chr5	55467626	AATGGAGTTTACTGCCCGTTTGG	AATGGgGTTTAaaGCCCaTTTGG	4	Gossypiumhirsutum_1880	mRNA	ID=rna-XM_016830308.2;Parent=gene-LOC107904036;Dbxref=GeneID:107904036,GenBank:XM_016830308.2;Name=XM_016830308.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107904036;model_evidence=Supporting
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chr4	13808350	AGATGAAGGGAGATTACCATAGG	AaATGAAGGGAGATTACCAaAGG	2	Gossypiumhirsutum_2115	.	.
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chr4	53749117	TTCCCGTACTTGTCGAAGAGCGG	TTCCCGTACTTaTCGAAcAatGG	4	Gossypiumhirsutum_2156	exon	ID=exon-XM_041090906.1-2;Parent=rna-XM_041090906.1;Dbxref=GeneID:107949131,GenBank:XM_041090906.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107949131;product=serine/arginine-rich
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chr4	7022350	AGACGGATGCCGTATCATTGTGG	gGtCcGATGCCGTATCATTtTGG	4	Gossypiumhirsutum_2157	mRNA	ID=rna-XM_041091837.1;Parent=gene-LOC107934323;Dbxref=GeneID:107934323,GenBank:XM_041091837.1;Name=XM_041091837.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107934323;model_evidence=Supporting
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chr4	17655894	TTGCATCATCAGCATCTCTAGGG	TTGCATCATCAGCATCTCTAGGG	0	Gossypiumhirsutum_2161	gene	ID=gene-LOC107899769;Dbxref=GeneID:107899769;Name=LOC107899769;description=serine/arginine-rich
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chr4	17655894	TTGCATCATCAGCATCTCTAGGG	TTGCATCATCAGCATCTCTAGGG	0	Gossypiumhirsutum_2161	exon	ID=exon-XM_016825561.2-4;Parent=rna-XM_016825561.2;Dbxref=GeneID:107899769,GenBank:XM_016825561.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107899769;product=serine/arginine-rich
chr4	17655894	TTGCATCATCAGCATCTCTAGGG	TTGCATCATCAGCATCTCTAGGG	0	Gossypiumhirsutum_2161	CDS	ID=cds-XP_016681050.1;Parent=rna-XM_016825561.2;Dbxref=GeneID:107899769,GenBank:XP_016681050.1;Name=XP_016681050.1;gbkey=CDS;gene=LOC107899769;product=serine/arginine-rich
chr4	9068496	ACATGTTTAGCAGATACGGGAGG	AaATGTTTAcCtGATAgGGGAGG	4	Gossypiumhirsutum_2162	.	.
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chr4	17655086	ACATGTTTAGCAGATACGGGAGG	ACATGTTTAGgAGATAtGGGAGG	2	Gossypiumhirsutum_2163	mRNA	ID=rna-XM_016825562.2;Parent=gene-LOC107899769;Dbxref=GeneID:107899769,GenBank:XM_016825562.2;Name=XM_016825562.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107899769;model_evidence=Supporting
chr4	17655086	ACATGTTTAGCAGATACGGGAGG	ACATGTTTAGgAGATAtGGGAGG	2	Gossypiumhirsutum_2163	exon	ID=exon-XM_016825562.2-2;Parent=rna-XM_016825562.2;Dbxref=GeneID:107899769,GenBank:XM_016825562.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107899769;product=serine/arginine-rich
chr4	17655086	ACATGTTTAGCAGATACGGGAGG	ACATGTTTAGgAGATAtGGGAGG	2	Gossypiumhirsutum_2163	CDS	ID=cds-XP_016681051.1;Parent=rna-XM_016825562.2;Dbxref=GeneID:107899769,GenBank:XP_016681051.1;Name=XP_016681051.1;gbkey=CDS;gene=LOC107899769;product=serine/arginine-rich
chr4	17655086	ACATGTTTAGCAGATACGGGAGG	ACATGTTTAGgAGATAtGGGAGG	2	Gossypiumhirsutum_2163	mRNA	ID=rna-XM_016825561.2;Parent=gene-LOC107899769;Dbxref=GeneID:107899769,GenBank:XM_016825561.2;Name=XM_016825561.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107899769;model_evidence=Supporting
chr4	17655086	ACATGTTTAGCAGATACGGGAGG	ACATGTTTAGgAGATAtGGGAGG	2	Gossypiumhirsutum_2163	exon	ID=exon-XM_016825561.2-2;Parent=rna-XM_016825561.2;Dbxref=GeneID:107899769,GenBank:XM_016825561.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107899769;product=serine/arginine-rich
chr4	17655086	ACATGTTTAGCAGATACGGGAGG	ACATGTTTAGgAGATAtGGGAGG	2	Gossypiumhirsutum_2163	CDS	ID=cds-XP_016681050.1;Parent=rna-XM_016825561.2;Dbxref=GeneID:107899769,GenBank:XP_016681050.1;Name=XP_016681050.1;gbkey=CDS;gene=LOC107899769;product=serine/arginine-rich
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chr4	17655925	TTGAATGGTCGAGACTTAGATGG	TTGAATGGTaGAGACcTtGATGG	3	Gossypiumhirsutum_2164	CDS	ID=cds-XP_016681050.1;Parent=rna-XM_016825561.2;Dbxref=GeneID:107899769,GenBank:XP_016681050.1;Name=XP_016681050.1;gbkey=CDS;gene=LOC107899769;product=serine/arginine-rich
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chr4	9068496	ACATGTTTAGCAGATATGGGAGG	AaATGTTTAcCtGATAgGGGAGG	4	Gossypiumhirsutum_2166	.	.
chr4	17655086	ACATGTTTAGCAGATATGGGAGG	ACATGTTTAGgAGATATGGGAGG	1	Gossypiumhirsutum_2167	gene	ID=gene-LOC107899769;Dbxref=GeneID:107899769;Name=LOC107899769;description=serine/arginine-rich
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chr4	17655086	ACATGTTTAGCAGATATGGGAGG	ACATGTTTAGgAGATATGGGAGG	1	Gossypiumhirsutum_2167	exon	ID=exon-XM_016825562.2-2;Parent=rna-XM_016825562.2;Dbxref=GeneID:107899769,GenBank:XM_016825562.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107899769;product=serine/arginine-rich
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chr4	17655086	ACATGTTTAGCAGATATGGGAGG	ACATGTTTAGgAGATATGGGAGG	1	Gossypiumhirsutum_2167	mRNA	ID=rna-XM_016825561.2;Parent=gene-LOC107899769;Dbxref=GeneID:107899769,GenBank:XM_016825561.2;Name=XM_016825561.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107899769;model_evidence=Supporting
chr4	17655086	ACATGTTTAGCAGATATGGGAGG	ACATGTTTAGgAGATATGGGAGG	1	Gossypiumhirsutum_2167	exon	ID=exon-XM_016825561.2-2;Parent=rna-XM_016825561.2;Dbxref=GeneID:107899769,GenBank:XM_016825561.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107899769;product=serine/arginine-rich
chr4	17655086	ACATGTTTAGCAGATATGGGAGG	ACATGTTTAGgAGATATGGGAGG	1	Gossypiumhirsutum_2167	CDS	ID=cds-XP_016681050.1;Parent=rna-XM_016825561.2;Dbxref=GeneID:107899769,GenBank:XP_016681050.1;Name=XP_016681050.1;gbkey=CDS;gene=LOC107899769;product=serine/arginine-rich
chr4	84701	AAAGGCGTGTACCACTACCGCGG	AAtcGCtTGTACCACTACCtCGG	4	Gossypiumhirsutum_2168	.	.
chr4	87211788	AAAGGCGTGTACCACTACCGCGG	AAtcGCtTGTACCACTACCtCGG	4	Gossypiumhirsutum_2169	gene	ID=gene-LOC107898698;Dbxref=GeneID:107898698;Name=LOC107898698;description=xanthotoxin
chr4	87211788	AAAGGCGTGTACCACTACCGCGG	AAtcGCtTGTACCACTACCtCGG	4	Gossypiumhirsutum_2169	mRNA	ID=rna-XM_041111685.1;Parent=gene-LOC107898698;Dbxref=GeneID:107898698,GenBank:XM_041111685.1;Name=XM_041111685.1;Note=The
chr4	17655018	AAAGGCGTGTACCACTACCGCGG	AAAGGCGTGTACCACTACCGCGG	0	Gossypiumhirsutum_2170	gene	ID=gene-LOC107899769;Dbxref=GeneID:107899769;Name=LOC107899769;description=serine/arginine-rich
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chr4	17655018	AAAGGCGTGTACCACTACCGCGG	AAAGGCGTGTACCACTACCGCGG	0	Gossypiumhirsutum_2170	exon	ID=exon-XM_016825562.2-2;Parent=rna-XM_016825562.2;Dbxref=GeneID:107899769,GenBank:XM_016825562.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107899769;product=serine/arginine-rich
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chr4	23945539	GGTGGGAGAAAAAAGTAGATAGG	GGTGGGAcAtAAAAGTtGAaAGG	4	Gossypiumhirsutum_2176	mRNA	ID=rna-XM_041091292.1;Parent=gene-LOC107898302;Dbxref=GeneID:107898302,GenBank:XM_041091292.1;Name=XM_041091292.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107898302;model_evidence=Supporting
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chr4	23945539	GGTGGGAGAAAAAAGTAGATAGG	GGTGGGAcAtAAAAGTtGAaAGG	4	Gossypiumhirsutum_2176	mRNA	ID=rna-XM_041091290.1;Parent=gene-LOC107898302;Dbxref=GeneID:107898302,GenBank:XM_041091290.1;Name=XM_041091290.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107898302;model_evidence=Supporting
chr4	23945539	GGTGGGAGAAAAAAGTAGATAGG	GGTGGGAcAtAAAAGTtGAaAGG	4	Gossypiumhirsutum_2176	exon	ID=exon-XM_041091290.1-4;Parent=rna-XM_041091290.1;Dbxref=GeneID:107898302,GenBank:XM_041091290.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107898302;product=uncharacterized
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chr4	49467848	TCACGACTATGTTTATTGCCA	TCAgGACaATtTTTgTTGCCAGG	4	Gossypiumhirsutum_2389	CDS	ID=cds-XP_016680851.1;Parent=rna-XM_016825362.2;Dbxref=GeneID:107899601,GenBank:XP_016680851.1;Name=XP_016680851.1;gbkey=CDS;gene=LOC107899601;product=polygalacturonase;protein_id=XP_016680851.1
chr4	9384748	CATGGGGCAAACTAATGGATTGG	tATGGaGCAgAtTAATGGATTGG	4	Gossypiumhirsutum_2390	.	.
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chr4	15652544	GCAGCTACCATAGATGTGGAAGG	GCAGCcACCtTAGATGTacAAGG	4	Gossypiumhirsutum_2393	.	.
chr4	235738	GCAGCTACCATAGATGTGGAAGG	GtAGCcACCtTAGATGTGtAAGG	4	Gossypiumhirsutum_2394	.	.
chr4	14760261	GCAGCTACCATAGATGTGGAAGG	GCAGCTACCtTAGATGaacAAGG	4	Gossypiumhirsutum_2395	.	.
chr4	257618	GCAGCTACCATAGATGTGGAAGG	GtAGCcACCtTAGATGTGtAAGG	4	Gossypiumhirsutum_2396	.	.
chr4	48577681	GCAGCTACCATAGATGTGGAAGG	GtAcCTACCATAGATtTGGtAGG	4	Gossypiumhirsutum_2397	.	.
chr4	73498209	GGCTACTCTGCCATACAATTTGG	GGacACTCTcCaATACAATTTGG	4	Gossypiumhirsutum_2398	.	.
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chr3	17855383	TTGCATCATCAGCATCTCTAGGG	TTGCATCAaCAcCtaCTCTAGGG	4	Gossypiumhirsutum_2481	.	.
chr3	14747956	TTGCATCATCAGCATCTCTAGGG	cTGCATCAaCAcCtTCTCTAGGG	4	Gossypiumhirsutum_2482	.	.
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chr3	819150	TTGAATGGTCGAGACTTAGATGG	TTGAATcGTttAGACTcAGATGG	4	Gossypiumhirsutum_2484	gene	ID=gene-LOC107933729;Dbxref=GeneID:107933729;Name=LOC107933729;description=MND1-interacting
chr3	819150	TTGAATGGTCGAGACTTAGATGG	TTGAATcGTttAGACTcAGATGG	4	Gossypiumhirsutum_2484	mRNA	ID=rna-XM_016866007.2;Parent=gene-LOC107933729;Dbxref=GeneID:107933729,GenBank:XM_016866007.2;Name=XM_016866007.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107933729;model_evidence=Supporting
chr3	819150	TTGAATGGTCGAGACTTAGATGG	TTGAATcGTttAGACTcAGATGG	4	Gossypiumhirsutum_2484	exon	ID=exon-XM_016866007.2-2;Parent=rna-XM_016866007.2;Dbxref=GeneID:107933729,GenBank:XM_016866007.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107933729;product=MND1-interacting
chr3	819150	TTGAATGGTCGAGACTTAGATGG	TTGAATcGTttAGACTcAGATGG	4	Gossypiumhirsutum_2484	CDS	ID=cds-XP_016721496.2;Parent=rna-XM_016866007.2;Dbxref=GeneID:107933729,GenBank:XP_016721496.2;Name=XP_016721496.2;gbkey=CDS;gene=LOC107933729;product=MND1-interacting
chr3	95750632	TTGAATGGTCGAGACTTAGATGG	TTGAAaGGTCGAGtacTAGATGG	4	Gossypiumhirsutum_2485	.	.
chr3	54317492	TTGAATGGTCGAGACTTAGATGG	TTGAATcGTttAGACTcAGATGG	4	Gossypiumhirsutum_2486	gene	ID=gene-LOC121215624;Dbxref=GeneID:121215624;Name=LOC121215624;description=MND1-interacting
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chr3	54317492	TTGAATGGTCGAGACTTAGATGG	TTGAATcGTttAGACTcAGATGG	4	Gossypiumhirsutum_2486	exon	ID=exon-XM_041090629.1-2;Parent=rna-XM_041090629.1;Dbxref=GeneID:121215624,GenBank:XM_041090629.1;gbkey=mRNA;gene=LOC121215624;product=MND1-interacting
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chr3	8492975	CATTCTCCTCATCGTTGTTGTGG	tATTtTCaTCATaGTTGTTGTGG	4	Gossypiumhirsutum_2539	exon	ID=exon-XM_016885430.2-7;Parent=rna-XM_016885430.2;Dbxref=GeneID:107950549,GenBank:XM_016885430.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107950549;product=syntaxin-21;transcript_id=XM_016885430.2
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chr3	103281881	TCAAGGACTGGATCTTTCGGAGG	TCAAGGAtTGaATCaTaCGGAGG	4	Gossypiumhirsutum_2541	.	.
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chr3	7612417	TCAAGGACTGGATCTTTCGGAGG	TCAAGcAtTtGATCTTTgGGAGG	4	Gossypiumhirsutum_2544	.	.
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chr13	67430134	TTGGCTGCTCACTGTGTTTATGG	TTGtCTGtTCACTtTGaTTATGG	4	Gossypiumhirsutum_3142	CDS	ID=cds-XP_016669990.1;Parent=rna-XM_016814501.1;Dbxref=GeneID:107889968,GenBank:XP_016669990.1;Name=XP_016669990.1;gbkey=CDS;gene=LOC107889968;product=uncharacterized
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chr13	2571648	TTGAATGGTCGAGACTTAGATGG	TTGAATGGTCGAGACTTgGATGG	1	Gossypiumhirsutum_3219	mRNA	ID=rna-XM_041084455.1;Parent=gene-LOC107940811;Dbxref=GeneID:107940811,GenBank:XM_041084455.1;Name=XM_041084455.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107940811;model_evidence=Supporting
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chr13	2570920	ACATGTTTAGCAGATATGGGAGG	ACATGTTTAGCAGATATGGGAGG	0	Gossypiumhirsutum_3224	mRNA	ID=rna-XM_016874271.2;Parent=gene-LOC107940811;Dbxref=GeneID:107940811,GenBank:XM_016874271.2;Name=XM_016874271.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107940811;model_evidence=Supporting
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chr13	2570838	CCTAGGTATGATGACCGCCGCGG	CCTAGGTATGATGACCGaCGtGG	2	Gossypiumhirsutum_3231	exon	ID=exon-XM_016874273.2-2;Parent=rna-XM_016874273.2;Dbxref=GeneID:107940811,GenBank:XM_016874273.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107940811;product=serine/arginine-rich
chr13	2570838	CCTAGGTATGATGACCGCCGCGG	CCTAGGTATGATGACCGaCGtGG	2	Gossypiumhirsutum_3231	CDS	ID=cds-XP_016729762.1;Parent=rna-XM_016874273.2;Dbxref=GeneID:107940811,GenBank:XP_016729762.1;Name=XP_016729762.1;gbkey=CDS;gene=LOC107940811;product=serine/arginine-rich
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chr13	43289894	CACGCCTCCTTGATAAGCCGAGG	CACGCCTCCTTGATAAGCCaAGG	1	Gossypiumhirsutum_3236	gene	ID=gene-LOC121225030;Dbxref=GeneID:121225030;Name=LOC121225030;description=probable
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chr13	43289894	CACGCCTCCTTGATAAGCCGAGG	CACGCCTCCTTGATAAGCCaAGG	1	Gossypiumhirsutum_3236	mRNA	ID=rna-XM_041108748.1;Parent=gene-LOC121225030;Dbxref=GeneID:121225030,GenBank:XM_041108748.1;Name=XM_041108748.1;gbkey=mRNA;gene=LOC121225030;model_evidence=Supporting
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chr13	43942857	TTTAGCAGCCTTTCACCTAATGG	TTTAaCAaaCTTTCACgTAATGG	4	Gossypiumhirsutum_3263	mRNA	ID=rna-XM_041086017.1;Parent=gene-LOC107893789;Dbxref=GeneID:107893789,GenBank:XM_041086017.1;Name=XM_041086017.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107893789;model_evidence=Supporting
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chr13	62227566	ACAACATCTGAAACACGAGGAGG	ACcACATtTGAAACACaAGGAaG	4	Gossypiumhirsutum_3272	mRNA	ID=rna-XM_041108671.1;Parent=gene-LOC121225012;Dbxref=GeneID:121225012,GenBank:XM_041108671.1;Name=XM_041108671.1;gbkey=mRNA;gene=LOC121225012;model_evidence=Supporting
chr13	104538607	ATAGGCATGACACTGGACATAGG	ATAGGCATGgaACTGGACgaAGG	4	Gossypiumhirsutum_3273	.	.
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chr13	58869037	ATAGGCATGACACTGGACATAGG	AcAGGCATGAaAgTaGACATAGG	4	Gossypiumhirsutum_3275	mRNA	ID=rna-XM_016812462.2;Parent=gene-LOC107888375;Dbxref=GeneID:107888375,GenBank:XM_016812462.2;Name=XM_016812462.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107888375;model_evidence=Supporting
chr13	58068661	ATAGGCATGACACTGGACATAGG	ATAGaCATGgaACTGGACAaAGG	4	Gossypiumhirsutum_3276	.	.
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chr13	32932702	TTCAGAGTCCGAATCGGACGAGG	TatgGAGTCCGAgTCGGACGAGG	4	Gossypiumhirsutum_3290	CDS	ID=cds-XP_040940790.1;Parent=rna-XM_041084856.1;Dbxref=GeneID:107893869,GenBank:XP_040940790.1;Name=XP_040940790.1;gbkey=CDS;gene=LOC107893869;product=uncharacterized
chr13	32932702	TTCAGAGTCCGAATCGGACGAGG	TatgGAGTCCGAgTCGGACGAGG	4	Gossypiumhirsutum_3290	gene	ID=gene-LOC107893869;Dbxref=GeneID:107893869;Name=LOC107893869;description=uncharacterized
chr13	32932702	TTCAGAGTCCGAATCGGACGAGG	TatgGAGTCCGAgTCGGACGAGG	4	Gossypiumhirsutum_3290	mRNA	ID=rna-XM_041084856.1;Parent=gene-LOC107893869;Dbxref=GeneID:107893869,GenBank:XM_041084856.1;Name=XM_041084856.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107893869;model_evidence=Supporting
chr13	101094097	TTCAGAGTCCGAATCGGACGAGG	TaCAGAGTCgGAATCaGACGAGG	3	Gossypiumhirsutum_3291	.	.
chr13	15546404	TTCAGAGTCCGAATCGGACGAGG	TatgGAGTCCGAgTCGGACGAGG	4	Gossypiumhirsutum_3292	exon	ID=exon-XM_016848813.2-3;Parent=rna-XM_016848813.2;Dbxref=GeneID:107919336,GenBank:XM_016848813.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107919336;product=uncharacterized
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chr13	104001507	ACCTGGATAACTTCAGCAAGCGG	ACCTGGAcAACTTCAtCAAGgaG	4	Gossypiumhirsutum_3302	exon	ID=exon-XM_041085539.1-8;Parent=rna-XM_041085539.1;Dbxref=GeneID:107893217,GenBank:XM_041085539.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107893217;product=bifunctional
chr13	104001507	ACCTGGATAACTTCAGCAAGCGG	ACCTGGAcAACTTCAtCAAGgaG	4	Gossypiumhirsutum_3302	CDS	ID=cds-XP_040941473.1;Parent=rna-XM_041085539.1;Dbxref=GeneID:107893217,GenBank:XP_040941473.1;Name=XP_040941473.1;gbkey=CDS;gene=LOC107893217;product=putative
chr13	104015910	ACCTGGATAACTTCAGCAAGCGG	ACCTGGAcAACTTCAtCAAGgaG	4	Gossypiumhirsutum_3303	pseudogene	ID=gene-LOC107893218;Dbxref=GeneID:107893218;Name=LOC107893218;description=bifunctional
chr13	104015910	ACCTGGATAACTTCAGCAAGCGG	ACCTGGAcAACTTCAtCAAGgaG	4	Gossypiumhirsutum_3303	exon	ID=id-LOC107893218-10;Parent=gene-LOC107893218;Dbxref=GeneID:107893218;gbkey=exon;gene=LOC107893218;model_evidence=Supporting
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chr13	46815082	GCAGGACCAGGAATAGCTGGTGG	GgAGGACCAGGAATAGgTatTGG	4	Gossypiumhirsutum_3334	exon	ID=exon-XM_041108963.1-5;Parent=rna-XM_041108963.1;Dbxref=GeneID:107919830,GenBank:XM_041108963.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107919830;product=uncharacterized
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chr13	60028434	GACTTGGTGGACAAACCGGTTGG	GAgTTGGTGGcCAAgCtGGTTGG	4	Gossypiumhirsutum_3336	CDS	ID=cds-XP_040965304.1;Parent=rna-XM_041109370.1;Dbxref=GeneID:121225185,GenBank:XP_040965304.1;Name=XP_040965304.1;gbkey=CDS;gene=LOC121225185;product=kinesin-like
chr13	60028434	GACTTGGTGGACAAACCGGTTGG	GAgTTGGTGGcCAAgCtGGTTGG	4	Gossypiumhirsutum_3336	gene	ID=gene-LOC121225185;Dbxref=GeneID:121225185;Name=LOC121225185;description=kinesin-like
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chr13	55530878	GCCGTCATAGAATATTCAAGAAG	GCCaTCAgAGAATATTgAAGAAG	3	Gossypiumhirsutum_3337	gene	ID=gene-LOC107940147;Dbxref=GeneID:107940147;Name=LOC107940147;description=uncharacterized
chr13	55530878	GCCGTCATAGAATATTCAAGAAG	GCCaTCAgAGAATATTgAAGAAG	3	Gossypiumhirsutum_3337	lnc_RNA	ID=rna-XR_005923059.1;Parent=gene-LOC107940147;Dbxref=GeneID:107940147,GenBank:XR_005923059.1;Name=XR_005923059.1;gbkey=ncRNA;gene=LOC107940147;model_evidence=Supporting
chr13	55530878	GCCGTCATAGAATATTCAAGAAG	GCCaTCAgAGAATATTgAAGAAG	3	Gossypiumhirsutum_3337	exon	ID=exon-XR_005923059.1-1;Parent=rna-XR_005923059.1;Dbxref=GeneID:107940147,GenBank:XR_005923059.1;gbkey=ncRNA;gene=LOC107940147;product=uncharacterized
chr13	5452083	GCTAATGGTTATCCAAAGAGAGG	GCTgATGaTgATCCAAAtAGAGG	4	Gossypiumhirsutum_3338	gene	ID=gene-LOC121212217;Dbxref=GeneID:121212217;Name=LOC121212217;description=probable
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chr13	5452083	GCTAATGGTTATCCAAAGAGAGG	GCTgATGaTgATCCAAAtAGAGG	4	Gossypiumhirsutum_3338	CDS	ID=cds-XP_040940534.1;Parent=rna-XM_041084600.1;Dbxref=GeneID:121212217,GenBank:XP_040940534.1;Name=XP_040940534.1;gbkey=CDS;gene=LOC121212217;product=probable
chr13	5452083	GCTAATGGTTATCCAAAGAGAGG	GCTgATGaTgATCCAAAtAGAGG	4	Gossypiumhirsutum_3338	mRNA	ID=rna-XM_041084599.1;Parent=gene-LOC121212217;Dbxref=GeneID:121212217,GenBank:XM_041084599.1;Name=XM_041084599.1;gbkey=mRNA;gene=LOC121212217;model_evidence=Supporting
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chr13	5452083	GCTAATGGTTATCCAAAGAGAGG	GCTgATGaTgATCCAAAtAGAGG	4	Gossypiumhirsutum_3338	CDS	ID=cds-XP_040940533.1;Parent=rna-XM_041084599.1;Dbxref=GeneID:121212217,GenBank:XP_040940533.1;Name=XP_040940533.1;gbkey=CDS;gene=LOC121212217;product=probable
chr13	5452083	GCTAATGGTTATCCAAAGAGAGG	GCTgATGaTgATCCAAAtAGAGG	4	Gossypiumhirsutum_3338	exon	ID=exon-XR_005923556.1-5;Parent=rna-XR_005923556.1;Dbxref=GeneID:121225689,GenBank:XR_005923556.1;gbkey=misc_RNA;gene=LOC121225689;product=uncharacterized
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chr12	17471749	TTATACCATCGGACTTTGCTAGG	cTATACCATtGGACTTTtCcAGG	4	Gossypiumhirsutum_3566	exon	ID=exon-XM_041084078.1-11;Parent=rna-XM_041084078.1;Dbxref=GeneID:107938859,GenBank:XM_041084078.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107938859;product=B3
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chr12	3051686	CTCGGATCCGGCCAAGCAAACGG	CTaGGcTCCGGCCtAaCAAACGG	4	Gossypiumhirsutum_3603	exon	ID=exon-XR_001699198.2-1;Parent=rna-XR_001699198.2;Dbxref=GeneID:107953387,GenBank:XR_001699198.2;gbkey=ncRNA;gene=LOC107953387;product=uncharacterized
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chr12	14443531	CTCTGCACTGAATATTTGGTTGG	tTCTGCAaTGAATAaTTGGTTGG	3	Gossypiumhirsutum_3708	mRNA	ID=rna-XM_016875034.1;Parent=gene-LOC107941466;Dbxref=GeneID:107941466,GenBank:XM_016875034.1;Name=XM_016875034.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107941466;model_evidence=Supporting
chr12	38186730	CTCTGCACTGAATATTTGGTTGG	CTCTGCAtTccATATTTGtTTGG	4	Gossypiumhirsutum_3709	.	.
chr12	106644991	AAACAGGTCAGATAACCCATTGG	cAACAGGcCAGATAACaCAgTGG	4	Gossypiumhirsutum_3710	exon	ID=exon-XM_016860935.2-11;Parent=rna-XM_016860935.2;Dbxref=GeneID:107929500,GenBank:XM_016860935.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107929500;product=putative
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chr12	106644991	AAACAGGTCAGATAACCCATTGG	cAACAGGcCAGATAACaCAgTGG	4	Gossypiumhirsutum_3710	mRNA	ID=rna-XM_016860935.2;Parent=gene-LOC107929500;Dbxref=GeneID:107929500,GenBank:XM_016860935.2;Name=XM_016860935.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107929500;model_evidence=Supporting
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chr12	105935820	AATTGGGGTCCAGTTTCGAGNNN	AATTGGGGTCCAGTTTCGAGAGG	0	Gossypiumhirsutum_3852	CDS	ID=cds-XP_016737274.2;Parent=rna-XM_016881785.2;Dbxref=GeneID:107947206,GenBank:XP_016737274.2;Name=XP_016737274.2;gbkey=CDS;gene=LOC107947206;product=transcription
chr12	7458071	AATTGGGGTCCAGTTTCGAGNNN	AcTTGGGGgCaAGgTTCGAGGAG	4	Gossypiumhirsutum_3853	.	.
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chr12	31464303	AATTGGGGTCCAGTTTCGAGNNN	AgcTGtGGTCCAGaTTCGAGAAG	4	Gossypiumhirsutum_3855	.	.
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chr12	81824	AATTGGGGTCCAGTTTCGAGNNN	AgcTGtGGTCCAGaTTCGAGAAG	4	Gossypiumhirsutum_3857	gene	ID=gene-LOC107942703;Dbxref=GeneID:107942703;Name=LOC107942703;description=lariat
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chr12	40170386	AATTGGGGTCCAGTTTCGAGNNN	AgcTGtGGTCCAGaTTCGAGGAG	4	Gossypiumhirsutum_3858	.	.
chr12	59840521	AATTGGGGTCCAGTTTCGAGNNN	AATTGGGGTCCAGTTTCGAGAGG	0	Gossypiumhirsutum_3859	gene	ID=gene-LOC121224354;Dbxref=GeneID:121224354;Name=LOC121224354;description=transcription
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chr12	59840521	AATTGGGGTCCAGTTTCGAGNNN	AATTGGGGTCCAGTTTCGAGAGG	0	Gossypiumhirsutum_3859	exon	ID=exon-XM_041107517.1-1;Parent=rna-XM_041107517.1;Dbxref=GeneID:121224354,GenBank:XM_041107517.1;gbkey=mRNA;gene=LOC121224354;product=transcription
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chr11	35311287	AATTGGGGTCCAGTTTCGAGNNN	AAaTGGGGTCCAacTTtGAGGAG	4	Gossypiumhirsutum_4270	CDS	ID=cds-XP_016694570.1;Parent=rna-XM_016839081.1;Dbxref=GeneID:107911200,GenBank:XP_016694570.1;Name=XP_016694570.1;gbkey=CDS;gene=LOC107911200;product=uncharacterized
chr11	22274489	AATTGGGGTCCAGTTTCGAGNNN	AATaGcGGTCtAGTTTCGAaAAG	4	Gossypiumhirsutum_4271	.	.
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chr11	27086969	AGTGATGGACGTGGACCGTANNN	AGaGATGGACaTtcACCGTACAG	4	Gossypiumhirsutum_4273	mRNA	ID=rna-XM_016827388.2;Parent=gene-LOC107901391;Dbxref=GeneID:107901391,GenBank:XM_016827388.2;Name=XM_016827388.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107901391;model_evidence=Supporting
chr11	27086969	AGTGATGGACGTGGACCGTANNN	AGaGATGGACaTtcACCGTACAG	4	Gossypiumhirsutum_4273	mRNA	ID=rna-XM_016827392.2;Parent=gene-LOC107901391;Dbxref=GeneID:107901391,GenBank:XM_016827392.2;Name=XM_016827392.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107901391;model_evidence=Supporting
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chr11	89846775	AGTGATGGACGTGGACCGTANNN	AGTGATtGACtTGGACtGTgTGG	4	Gossypiumhirsutum_4275	.	.
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chr11	92372697	AGTGATGGACGTGGACCGTANNN	AGTGATGaACaTGGtCCaTATGG	4	Gossypiumhirsutum_4277	.	.
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chr10	7071189	AAAGGCGTGTACCACTACCGCGG	AAtcGCtTGTACCACTACCtCGG	4	Gossypiumhirsutum_4447	mRNA	ID=rna-XM_041079710.1;Parent=gene-LOC107897398;Dbxref=GeneID:107897398,GenBank:XM_041079710.1;Name=XM_041079710.1;Note=The
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chr10	333967	TGTAGAACTTTGAAGCTAGCTGG	TtTAGAACTTTaAAGCTAaaTGG	4	Gossypiumhirsutum_4467	mRNA	ID=rna-XM_016862067.2;Parent=gene-LOC107930407;Dbxref=GeneID:107930407,GenBank:XM_016862067.2;Name=XM_016862067.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107930407;model_evidence=Supporting
chr10	11335767	CACGCCTCCTTGATAAGCCAAGG	CcCGCCTCaTTtATAAGCCAtGG	4	Gossypiumhirsutum_4468	.	.
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chr10	4616940	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAgGTTATGgAGCAACTGCATGG	2	Gossypiumhirsutum_4488	exon	ID=exon-XM_041102885.1-5;Parent=rna-XM_041102885.1;Dbxref=GeneID:107915685,GenBank:XM_041102885.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107915685;product=STE20/SPS1-related
chr10	4616940	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAgGTTATGgAGCAACTGCATGG	2	Gossypiumhirsutum_4488	CDS	ID=cds-XP_040958819.1;Parent=rna-XM_041102885.1;Dbxref=GeneID:107915685,GenBank:XP_040958819.1;Name=XP_040958819.1;gbkey=CDS;gene=LOC107915685;product=STE20/SPS1-related
chr10	4616940	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAgGTTATGgAGCAACTGCATGG	2	Gossypiumhirsutum_4488	exon	ID=exon-XM_041102887.1-5;Parent=rna-XM_041102887.1;Dbxref=GeneID:107915685,GenBank:XM_041102887.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107915685;product=STE20/SPS1-related
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chr10	4616940	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAgGTTATGgAGCAACTGCATGG	2	Gossypiumhirsutum_4488	mRNA	ID=rna-XM_041102886.1;Parent=gene-LOC107915685;Dbxref=GeneID:107915685,GenBank:XM_041102886.1;Name=XM_041102886.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107915685;model_evidence=Supporting
chr10	4616940	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAgGTTATGgAGCAACTGCATGG	2	Gossypiumhirsutum_4488	mRNA	ID=rna-XM_041102885.1;Parent=gene-LOC107915685;Dbxref=GeneID:107915685,GenBank:XM_041102885.1;Name=XM_041102885.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107915685;model_evidence=Supporting
chr10	4616940	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAgGTTATGgAGCAACTGCATGG	2	Gossypiumhirsutum_4488	mRNA	ID=rna-XM_041102887.1;Parent=gene-LOC107915685;Dbxref=GeneID:107915685,GenBank:XM_041102887.1;Name=XM_041102887.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107915685;model_evidence=Supporting
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chr10	6961684	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAAcTTcaGCtGCAACTGCATGG	4	Gossypiumhirsutum_4489	exon	ID=exon-XM_016822833.2-7;Parent=rna-XM_016822833.2;Dbxref=GeneID:107897385,GenBank:XM_016822833.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107897385;product=inactive
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chr10	6961684	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAAcTTcaGCtGCAACTGCATGG	4	Gossypiumhirsutum_4489	exon	ID=exon-XM_041079707.1-7;Parent=rna-XM_041079707.1;Dbxref=GeneID:107897385,GenBank:XM_041079707.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107897385;product=inactive
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chr10	6961684	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAAcTTcaGCtGCAACTGCATGG	4	Gossypiumhirsutum_4489	mRNA	ID=rna-XM_041079705.1;Parent=gene-LOC107897385;Dbxref=GeneID:107897385,GenBank:XM_041079705.1;Name=XM_041079705.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107897385;model_evidence=Supporting
chr10	6961684	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAAcTTcaGCtGCAACTGCATGG	4	Gossypiumhirsutum_4489	mRNA	ID=rna-XM_016822830.2;Parent=gene-LOC107897385;Dbxref=GeneID:107897385,GenBank:XM_016822830.2;Name=XM_016822830.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107897385;model_evidence=Supporting
chr10	6961684	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAAcTTcaGCtGCAACTGCATGG	4	Gossypiumhirsutum_4489	mRNA	ID=rna-XM_016822832.2;Parent=gene-LOC107897385;Dbxref=GeneID:107897385,GenBank:XM_016822832.2;Name=XM_016822832.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107897385;model_evidence=Supporting
chr10	6961684	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAAcTTcaGCtGCAACTGCATGG	4	Gossypiumhirsutum_4489	mRNA	ID=rna-XM_041079706.1;Parent=gene-LOC107897385;Dbxref=GeneID:107897385,GenBank:XM_041079706.1;Name=XM_041079706.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107897385;model_evidence=Supporting
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chr10	13851207	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAAcTTcaGCtGCAACTGCATGG	4	Gossypiumhirsutum_4495	gene	ID=gene-LOC121222424;Dbxref=GeneID:121222424;Name=LOC121222424;description=uncharacterized
chr10	13851207	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAAcTTcaGCtGCAACTGCATGG	4	Gossypiumhirsutum_4495	lnc_RNA	ID=rna-XR_005919694.1;Parent=gene-LOC121222424;Dbxref=GeneID:121222424,GenBank:XR_005919694.1;Name=XR_005919694.1;gbkey=ncRNA;gene=LOC121222424;model_evidence=Supporting
chr10	13851207	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAAcTTcaGCtGCAACTGCATGG	4	Gossypiumhirsutum_4495	exon	ID=exon-XR_005919694.1-2;Parent=rna-XR_005919694.1;Dbxref=GeneID:121222424,GenBank:XR_005919694.1;gbkey=ncRNA;gene=LOC121222424;product=uncharacterized
chr10	4616940	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAgGTTATGgAGCAACTGCATGG	2	Gossypiumhirsutum_4496	exon	ID=exon-XM_041102886.1-5;Parent=rna-XM_041102886.1;Dbxref=GeneID:107915685,GenBank:XM_041102886.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107915685;product=STE20/SPS1-related
chr10	4616940	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAgGTTATGgAGCAACTGCATGG	2	Gossypiumhirsutum_4496	CDS	ID=cds-XP_040958820.1;Parent=rna-XM_041102886.1;Dbxref=GeneID:107915685,GenBank:XP_040958820.1;Name=XP_040958820.1;gbkey=CDS;gene=LOC107915685;product=STE20/SPS1-related
chr10	4616940	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAgGTTATGgAGCAACTGCATGG	2	Gossypiumhirsutum_4496	exon	ID=exon-XM_041102885.1-5;Parent=rna-XM_041102885.1;Dbxref=GeneID:107915685,GenBank:XM_041102885.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107915685;product=STE20/SPS1-related
chr10	4616940	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAgGTTATGgAGCAACTGCATGG	2	Gossypiumhirsutum_4496	CDS	ID=cds-XP_040958819.1;Parent=rna-XM_041102885.1;Dbxref=GeneID:107915685,GenBank:XP_040958819.1;Name=XP_040958819.1;gbkey=CDS;gene=LOC107915685;product=STE20/SPS1-related
chr10	4616940	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAgGTTATGgAGCAACTGCATGG	2	Gossypiumhirsutum_4496	exon	ID=exon-XM_041102887.1-5;Parent=rna-XM_041102887.1;Dbxref=GeneID:107915685,GenBank:XM_041102887.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107915685;product=STE20/SPS1-related
chr10	4616940	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAgGTTATGgAGCAACTGCATGG	2	Gossypiumhirsutum_4496	CDS	ID=cds-XP_040958821.1;Parent=rna-XM_041102887.1;Dbxref=GeneID:107915685,GenBank:XP_040958821.1;Name=XP_040958821.1;gbkey=CDS;gene=LOC107915685;product=STE20/SPS1-related
chr10	4616940	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAgGTTATGgAGCAACTGCATGG	2	Gossypiumhirsutum_4496	gene	ID=gene-LOC107915685;Dbxref=GeneID:107915685;Name=LOC107915685;description=STE20/SPS1-related
chr10	4616940	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAgGTTATGgAGCAACTGCATGG	2	Gossypiumhirsutum_4496	mRNA	ID=rna-XM_041102886.1;Parent=gene-LOC107915685;Dbxref=GeneID:107915685,GenBank:XM_041102886.1;Name=XM_041102886.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107915685;model_evidence=Supporting
chr10	4616940	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAgGTTATGgAGCAACTGCATGG	2	Gossypiumhirsutum_4496	mRNA	ID=rna-XM_041102885.1;Parent=gene-LOC107915685;Dbxref=GeneID:107915685,GenBank:XM_041102885.1;Name=XM_041102885.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107915685;model_evidence=Supporting
chr10	4616940	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAgGTTATGgAGCAACTGCATGG	2	Gossypiumhirsutum_4496	mRNA	ID=rna-XM_041102887.1;Parent=gene-LOC107915685;Dbxref=GeneID:107915685,GenBank:XM_041102887.1;Name=XM_041102887.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107915685;model_evidence=Supporting
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chr1	41395569	TTAAGACCAGATATCAAAAGAGG	TTAgaACCAGAaATtAAAAGAGG	4	Gossypiumhirsutum_4799	.	.
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chr1	63862476	TTGAATGGTCGAGACTTAGATGG	TTGgATGGTCGgGACTTtGATGG	3	Gossypiumhirsutum_4883	exon	ID=exon-XM_016831868.2-4;Parent=rna-XM_016831868.2;Dbxref=GeneID:107905262,GenBank:XM_016831868.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107905262;product=serine/arginine-rich
chr1	63862476	TTGAATGGTCGAGACTTAGATGG	TTGgATGGTCGgGACTTtGATGG	3	Gossypiumhirsutum_4883	CDS	ID=cds-XP_016687357.1;Parent=rna-XM_016831868.2;Dbxref=GeneID:107905262,GenBank:XP_016687357.1;Name=XP_016687357.1;gbkey=CDS;gene=LOC107905262;product=serine/arginine-rich
chr1	115667391	ACATGTTTAGCAGATATGGGAGG	AaATGTTTAGCAGATgaGGGAaG	4	Gossypiumhirsutum_4884	gene	ID=gene-LOC121229716;Dbxref=GeneID:121229716;Name=LOC121229716;description=uncharacterized
chr1	115667391	ACATGTTTAGCAGATATGGGAGG	AaATGTTTAGCAGATgaGGGAaG	4	Gossypiumhirsutum_4884	lnc_RNA	ID=rna-XR_005927636.1;Parent=gene-LOC121229716;Dbxref=GeneID:121229716,GenBank:XR_005927636.1;Name=XR_005927636.1;gbkey=ncRNA;gene=LOC121229716;model_evidence=Supporting
chr1	115667391	ACATGTTTAGCAGATATGGGAGG	AaATGTTTAGCAGATgaGGGAaG	4	Gossypiumhirsutum_4884	exon	ID=exon-XR_005927636.1-2;Parent=rna-XR_005927636.1;Dbxref=GeneID:121229716,GenBank:XR_005927636.1;gbkey=ncRNA;gene=LOC121229716;product=uncharacterized
chr1	9073906	ACATGTTTAGCAGATATGGGAGG	ACATGTaTAGCAGATATatGtGG	4	Gossypiumhirsutum_4885	.	.
chr1	4984549	AAAGGCGTGTACCACTACCGCGG	AAtcGCtTGTACCACTACCtCGG	4	Gossypiumhirsutum_4886	gene	ID=gene-LOC107940619;Dbxref=GeneID:107940619;Name=LOC107940619;description=rust
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chr1	4984549	AAAGGCGTGTACCACTACCGCGG	AAtcGCtTGTACCACTACCtCGG	4	Gossypiumhirsutum_4886	exon	ID=exon-XR_005899653.1-3;Parent=rna-XR_005899653.1;Dbxref=GeneID:107940619,GenBank:XR_005899653.1;gbkey=misc_RNA;gene=LOC107940619;product=rust
chr1	2517039	AAAGGCGTGTACCACTACCGCGG	AAtcGCtTGTACCACTACCtCGG	4	Gossypiumhirsutum_4887	gene	ID=gene-LOC121232278;Dbxref=GeneID:121232278;Name=LOC121232278;description=receptor-like
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chr1	7825424	AAAGGCGTGTACCACTACCGCGG	AAtcGCtTGTACCACTACCtCGG	4	Gossypiumhirsutum_4888	gene	ID=gene-LOC107916591;Dbxref=GeneID:107916591;Name=LOC107916591;description=probable
chr1	7825424	AAAGGCGTGTACCACTACCGCGG	AAtcGCtTGTACCACTACCtCGG	4	Gossypiumhirsutum_4888	mRNA	ID=rna-XM_016845879.2;Parent=gene-LOC107916591;Dbxref=GeneID:107916591,GenBank:XM_016845879.2;Name=XM_016845879.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107916591;model_evidence=Supporting
chr1	7825424	AAAGGCGTGTACCACTACCGCGG	AAtcGCtTGTACCACTACCtCGG	4	Gossypiumhirsutum_4888	mRNA	ID=rna-XM_016845878.2;Parent=gene-LOC107916591;Dbxref=GeneID:107916591,GenBank:XM_016845878.2;Name=XM_016845878.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107916591;model_evidence=Supporting
chr1	7825424	AAAGGCGTGTACCACTACCGCGG	AAtcGCtTGTACCACTACCtCGG	4	Gossypiumhirsutum_4888	mRNA	ID=rna-XM_016845874.2;Parent=gene-LOC107916591;Dbxref=GeneID:107916591,GenBank:XM_016845874.2;Name=XM_016845874.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107916591;model_evidence=Supporting
chr1	7825424	AAAGGCGTGTACCACTACCGCGG	AAtcGCtTGTACCACTACCtCGG	4	Gossypiumhirsutum_4888	mRNA	ID=rna-XM_016845873.2;Parent=gene-LOC107916591;Dbxref=GeneID:107916591,GenBank:XM_016845873.2;Name=XM_016845873.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107916591;model_evidence=Supporting
chr1	7825424	AAAGGCGTGTACCACTACCGCGG	AAtcGCtTGTACCACTACCtCGG	4	Gossypiumhirsutum_4888	mRNA	ID=rna-XM_016845876.2;Parent=gene-LOC107916591;Dbxref=GeneID:107916591,GenBank:XM_016845876.2;Name=XM_016845876.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107916591;model_evidence=Supporting
chr1	7825424	AAAGGCGTGTACCACTACCGCGG	AAtcGCtTGTACCACTACCtCGG	4	Gossypiumhirsutum_4888	mRNA	ID=rna-XM_016845875.2;Parent=gene-LOC107916591;Dbxref=GeneID:107916591,GenBank:XM_016845875.2;Name=XM_016845875.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107916591;model_evidence=Supporting
chr1	118288847	AAGCAGCGACCAGATCCAGGAGG	AAGCAGCGACCAGATCCAGGAGG	0	Gossypiumhirsutum_4889	gene	ID=gene-LOC107957972;Dbxref=GeneID:107957972;Name=LOC107957972;description=serine/arginine-rich
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chr1	118288847	AAGCAGCGACCAGATCCAGGAGG	AAGCAGCGACCAGATCCAGGAGG	0	Gossypiumhirsutum_4889	exon	ID=exon-XM_016893606.2-5;Parent=rna-XM_016893606.2;Dbxref=GeneID:107957972,GenBank:XM_016893606.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107957972;product=serine/arginine-rich
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chr1	118288847	AAGCAGCGACCAGATCCAGGAGG	AAGCAGCGACCAGATCCAGGAGG	0	Gossypiumhirsutum_4889	exon	ID=exon-XM_041115413.1-5;Parent=rna-XM_041115413.1;Dbxref=GeneID:107957972,GenBank:XM_041115413.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107957972;product=serine/arginine-rich
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chr1	63862294	AAGCAGCGACCAGATCCAGGAGG	AAGCAGCGACCAGATCCAGGAGG	0	Gossypiumhirsutum_4890	exon	ID=exon-XM_016831866.2-5;Parent=rna-XM_016831866.2;Dbxref=GeneID:107905262,GenBank:XM_016831866.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107905262;product=serine/arginine-rich
chr1	63862294	AAGCAGCGACCAGATCCAGGAGG	AAGCAGCGACCAGATCCAGGAGG	0	Gossypiumhirsutum_4890	CDS	ID=cds-XP_016687355.1;Parent=rna-XM_016831866.2;Dbxref=GeneID:107905262,GenBank:XP_016687355.1;Name=XP_016687355.1;gbkey=CDS;gene=LOC107905262;product=serine/arginine-rich
chr1	63862294	AAGCAGCGACCAGATCCAGGAGG	AAGCAGCGACCAGATCCAGGAGG	0	Gossypiumhirsutum_4890	mRNA	ID=rna-XM_016831865.2;Parent=gene-LOC107905262;Dbxref=GeneID:107905262,GenBank:XM_016831865.2;Name=XM_016831865.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107905262;model_evidence=Supporting
chr1	63862294	AAGCAGCGACCAGATCCAGGAGG	AAGCAGCGACCAGATCCAGGAGG	0	Gossypiumhirsutum_4890	exon	ID=exon-XM_016831865.2-5;Parent=rna-XM_016831865.2;Dbxref=GeneID:107905262,GenBank:XM_016831865.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107905262;product=serine/arginine-rich
chr1	63862294	AAGCAGCGACCAGATCCAGGAGG	AAGCAGCGACCAGATCCAGGAGG	0	Gossypiumhirsutum_4890	CDS	ID=cds-XP_016687354.1;Parent=rna-XM_016831865.2;Dbxref=GeneID:107905262,GenBank:XP_016687354.1;Name=XP_016687354.1;gbkey=CDS;gene=LOC107905262;product=serine/arginine-rich
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chr1	63862330	AGATATTCCCGAGAACCTCGTGG	AGATATTCCtGAGAACCTCGTGG	1	Gossypiumhirsutum_4892	exon	ID=exon-XM_016831868.2-5;Parent=rna-XM_016831868.2;Dbxref=GeneID:107905262,GenBank:XM_016831868.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107905262;product=serine/arginine-rich
chr1	63862330	AGATATTCCCGAGAACCTCGTGG	AGATATTCCtGAGAACCTCGTGG	1	Gossypiumhirsutum_4892	CDS	ID=cds-XP_016687357.1;Parent=rna-XM_016831868.2;Dbxref=GeneID:107905262,GenBank:XP_016687357.1;Name=XP_016687357.1;gbkey=CDS;gene=LOC107905262;product=serine/arginine-rich
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chr1	53794195	AATGCTGCAATAGTCCCGACCGG	AAgGCTGCAATAGTCCCaACtGG	3	Gossypiumhirsutum_4894	.	.
chr1	33684818	ATTCTTCATATTCAGCCAGGGGG	ATaCTaCATATTCgGCCAaGGGG	4	Gossypiumhirsutum_4895	.	.
chr1	38105217	CACGCCTCCTTGATAAGCCGAGG	tAaGCCaCCTTGATAAGCCaAGG	4	Gossypiumhirsutum_4896	.	.
chr1	22685768	AGCCGAGGCTTAACATAGAGAGG	AcCaGAGGCTTcACAaAGAGAGG	4	Gossypiumhirsutum_4897	.	.
chr1	14626229	GGTGGGAGAAAAAAGTAGATAGG	GGTGGGAGAAAAAAGaAGggtGG	4	Gossypiumhirsutum_4898	gene	ID=gene-LOC107918086;Dbxref=GeneID:107918086;Name=LOC107918086;description=protein
chr1	14626229	GGTGGGAGAAAAAAGTAGATAGG	GGTGGGAGAAAAAAGaAGggtGG	4	Gossypiumhirsutum_4898	mRNA	ID=rna-XM_041076869.1;Parent=gene-LOC107918086;Dbxref=GeneID:107918086,GenBank:XM_041076869.1;Name=XM_041076869.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107918086;model_evidence=Supporting
chr1	14626229	GGTGGGAGAAAAAAGTAGATAGG	GGTGGGAGAAAAAAGaAGggtGG	4	Gossypiumhirsutum_4898	exon	ID=exon-XM_041076869.1-1;Parent=rna-XM_041076869.1;Dbxref=GeneID:107918086,GenBank:XM_041076869.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107918086;product=protein
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chr1	12556022	GGTGGGAGAAAAAAGTAGATAGG	GGTGGGAGAAAAAAGaAGggtGG	4	Gossypiumhirsutum_4899	mRNA	ID=rna-XM_041087068.1;Parent=gene-LOC107922038;Dbxref=GeneID:107922038,GenBank:XM_041087068.1;Name=XM_041087068.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107922038;model_evidence=Supporting
chr1	12556022	GGTGGGAGAAAAAAGTAGATAGG	GGTGGGAGAAAAAAGaAGggtGG	4	Gossypiumhirsutum_4899	mRNA	ID=rna-XM_041087073.1;Parent=gene-LOC107922038;Dbxref=GeneID:107922038,GenBank:XM_041087073.1;Name=XM_041087073.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107922038;model_evidence=Supporting
chr1	12556022	GGTGGGAGAAAAAAGTAGATAGG	GGTGGGAGAAAAAAGaAGggtGG	4	Gossypiumhirsutum_4899	mRNA	ID=rna-XM_041087071.1;Parent=gene-LOC107922038;Dbxref=GeneID:107922038,GenBank:XM_041087071.1;Name=XM_041087071.1;gbkey=mRNA;gene=LOC107922038;model_evidence=Supporting
chr1	38768301	TGTAGAACTTTGAAGCTAGCTGG	aGTAGAACTcTGAAGCTAGtgGG	4	Gossypiumhirsutum_4900	pseudogene	ID=gene-LOC107921477;Dbxref=GeneID:107921477;Name=LOC107921477;description=non-lysosomal
chr1	27692314	TGTAGAACTTTGAAGCTAGCTGG	aGTAGAACTcTaAAGtTAGCTGG	4	Gossypiumhirsutum_4901	.	.
chr1	60086136	TATGCGGCAATGGTACCAACTGG	TATGCGaCAATGtgACCAAtTGG	4	Gossypiumhirsutum_4902	.	.
chr1	60086136	TATGCGGCAATGGTACCAACTGG	TATGCGaCAATGtgACCAAtTGG	4	Gossypiumhirsutum_4903	.	.
chr1	38105217	CACGCCTCCTTGATAAGCCAAGG	tAaGCCaCCTTGATAAGCCAAGG	3	Gossypiumhirsutum_4904	.	.
chr1	9236283	GTCGTCAGCTCCTTTCTCCGTGG	GTgGTCtaCTaCTTTCTCCGTGG	4	Gossypiumhirsutum_4905	gene	ID=gene-LOC107940019;Dbxref=GeneID:107940019;Name=LOC107940019;description=scarecrow-like
chr1	9236283	GTCGTCAGCTCCTTTCTCCGTGG	GTgGTCtaCTaCTTTCTCCGTGG	4	Gossypiumhirsutum_4905	mRNA	ID=rna-XM_016873425.2;Parent=gene-LOC107940019;Dbxref=GeneID:107940019,GenBank:XM_016873425.2;Name=XM_016873425.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107940019;model_evidence=Supporting
chr1	9236283	GTCGTCAGCTCCTTTCTCCGTGG	GTgGTCtaCTaCTTTCTCCGTGG	4	Gossypiumhirsutum_4905	exon	ID=exon-XM_016873425.2-2;Parent=rna-XM_016873425.2;Dbxref=GeneID:107940019,GenBank:XM_016873425.2;gbkey=mRNA;gene=LOC107940019;product=scarecrow-like
chr1	9236283	GTCGTCAGCTCCTTTCTCCGTGG	GTgGTCtaCTaCTTTCTCCGTGG	4	Gossypiumhirsutum_4905	CDS	ID=cds-XP_016728914.2;Parent=rna-XM_016873425.2;Dbxref=GeneID:107940019,GenBank:XP_016728914.2;Name=XP_016728914.2;gbkey=CDS;gene=LOC107940019;product=scarecrow-like
chr1	93985772	TATACTCCATCTCCGCCCAGAGG	TATcCTCCATgTCtGCCCAGAaG	4	Gossypiumhirsutum_4906	.	.
chr1	54943577	TCCTGGTCTTGACTACGAAAGGG	TCCcGaTCTaGACTAaGAAAGGG	4	Gossypiumhirsutum_4907	.	.
chr1	29378162	TCCTGGTCTTGACTACGAAAGGG	TgCTGaTCTaGACTAtGAAAGGG	4	Gossypiumhirsutum_4908	.	.
chr1	54951462	TCCTGGTCTTGACTACGAAAGGG	TCCcGaTCTaGACTAaGAAAGGG	4	Gossypiumhirsutum_4909	.	.
chr1	76778424	TCCTGGTCTTGACTACGAAAGGG	TgCcGaTCTTGACTACGAAAGGG	3	Gossypiumhirsutum_4910	.	.
chr1	29462231	TCCTGGTCTTGACTACGAAAGGG	TCCcGaTCTaGACTAtGAAAGGG	4	Gossypiumhirsutum_4911	.	.
chr1	89480583	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	aAAGTTATGaAGCAtCTGCATGG	3	Gossypiumhirsutum_4912	.	.
chr1	2725494	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAAcTTcaGCtGCAACTGCATGG	4	Gossypiumhirsutum_4913	gene	ID=gene-LOC121213746;Dbxref=GeneID:121213746;Name=LOC121213746;description=G-type
chr1	2725494	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAAcTTcaGCtGCAACTGCATGG	4	Gossypiumhirsutum_4913	transcript	ID=rna-XR_005909163.1;Parent=gene-LOC121213746;Dbxref=GeneID:121213746,GenBank:XR_005909163.1;Name=XR_005909163.1;gbkey=misc_RNA;gene=LOC121213746;model_evidence=Supporting
chr1	2725494	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAAcTTcaGCtGCAACTGCATGG	4	Gossypiumhirsutum_4913	exon	ID=exon-XR_005909163.1-1;Parent=rna-XR_005909163.1;Dbxref=GeneID:121213746,GenBank:XR_005909163.1;gbkey=misc_RNA;gene=LOC121213746;product=G-type
chr1	89480583	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	aAAGTTATGaAGCAtCTGCATGG	3	Gossypiumhirsutum_4914	.	.
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chr1	2725494	GAAGTTATGCAGCAACTGCATGG	GAAcTTcaGCtGCAACTGCATGG	4	Gossypiumhirsutum_4915	transcript	ID=rna-XR_005909163.1;Parent=gene-LOC121213746;Dbxref=GeneID:121213746,GenBank:XR_005909163.1;Name=XR_005909163.1;gbkey=misc_RNA;gene=LOC121213746;model_evidence=Supporting
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chr1	15705648	GAAGCTGCCTGTAAGATTTGNNN	GAAGCTGCCTaTAgacTTTGGGG	4	Gossypiumhirsutum_4966	CDS	ID=cds-XP_016707609.1;Parent=rna-XM_016852120.2;Dbxref=GeneID:107922217,GenBank:XP_016707609.1;Name=XP_016707609.1;gbkey=CDS;gene=LOC107922217;product=F-box/kelch-repeat
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chr1	3174826	GCTCAAACAGGTGATCATCA	GCTCAAACAGGTGATCATCAAGG	0	Gossypiumhirsutum_5082	CDS	ID=cds-NP_001314325.1;Parent=rna-NM_001327396.1;Dbxref=GeneID:107936158,GenBank:NP_001314325.1;Name=NP_001314325.1;Note=The
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chr1	9493468	AGTGATGGACGTGGACCGTANNN	AGTGtTGaACaTGGACtGTAAAG	4	Gossypiumhirsutum_5127	mRNA	ID=rna-XM_041086972.1;Parent=gene-LOC107932626;Dbxref=GeneID:107932626,GenBank:XM_041086972.1;Name=XM_041086972.1;Note=The
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